De ontploffing van de Citadel aan het slot van Half-Life 2 leek het einde van het verhaal voor Gordon en het absolute einde van Alyx. Gelukkig blijkt aan het begin van Episode One dat Alyx de gebeurtenissen heeft overleefd en Gordon toch mag doorvechten. Maar dan moeten ze wel eerst City 17 ontvluchten...Episode One is de eerste van een serie kortere uitbreidingen op Half-Life 2.
