Team Rainbow heeft in Rainbow Six: Lockdown geen werkgever die hen achter terroristen aan stuurt, maar persoonlijke motieven. Een lid van het team wordt tijdens een missie gevangen genomen en door terroristen zwaar mishandeld. Het team zweert wraak en gaat de strijd aan met de terroristen. Uiteraard sta jij aan de leiding van dit team.
Ondanks de goede multiplayer met diverse leuke mogelijkheden, werd de game niet zo goed ontvangen als voorganger Raven Shield. De reden daarvan was de gebrekkige AI, het matige leveldesign maar bovenal: het tactische element van de game was verdwenen. Raven Shield was tactisch en waanzinnig realistisch, maar Lockdown (ook op de pc) meer arcade.