Ga er maar eens lekker voor zitten, want Ape Escape 3 is alweer het derde deel dat verschijnt in de Ape Escape reeks. In alle delen is het al zo geweest dat je met een character (man/vrouw) allemaal ontsnapte apen moet zien te vangen en in dit derde deel is dat dan ook precies hetzelfde. De apen bedreigen voor de derde maal de wereld en ze zijn bezig de mensen te hersenspoelen door het uitzenden van tv-programma's die zo dom zijn dat iedereen die het ziet ook dom wordt. De apen zijn natuurlijk niet dom, en dus zal het een flinke opgave worden om alle apen te vangen. Gelukkig heb je de nodige gadgets tot je beschikking en ook is het mogelijk om te transformeren in een super-hero wanneer je genoeg energie hebt verzameld.
